Travailler en accès direct (sans SLURM)

Les serveurs en accès direct s'utilisent comme votre PC : vous vous connectez et vous lancez vos programmes directement, sans passer par SLURM. C'est idéal pour développer, tester, travailler en interactif, utiliser VS Code.

Vos fichiers sont les mêmes que sur le cluster : votre répertoire personnel est partagé entre tous les serveurs.

Serveur	Cœurs	Mémoire	GPU
christmas	64	512 Go
l40s02	32	125 Go	NVIDIA L40S

Ces serveurs sont partagés et aucun outil ne répartit les ressources entre les utilisateurs : c'est à vous de laisser de la place aux autres. Pour des calculs lourds ou nombreux, utilisez le cluster SLURM.

1. Se connecter

Si vous n'êtes pas dans le bâtiment ISIMA, connectez-vous d'abord au VPN. Puis, dans un terminal de votre PC, tapez :

ssh login@christmas

Remplacez login par votre identifiant et christmas par le serveur en accès direct de votre choix.

Vous pouvez aussi vous connecter avec VS Code, pour éditer vos fichiers et lancer vos commandes directement depuis l'éditeur.

2. Vérifier que le serveur n'est pas trop chargé

Avant de lancer un programme, regardez ce qui tourne déjà. Dans le terminal, tapez :

top

La liste montre les programmes en cours et la mémoire libre (ligne MiB Mem). Tapez q pour quitter.

Sur les serveurs avec GPU, regardez aussi l'occupation des cartes :

nvidia-smi

3. Lancer son programme

Lancez votre programme comme sur votre PC :

./mon_exe

Dans une image Apptainer

Pour travailler dans votre image (voir Apptainer), ouvrez un terminal à l'intérieur de l'image :

apptainer shell mon_image.sif

Le début de la ligne de commande devient Apptainer> : vous êtes dans l'image, avec tous les logiciels que vous y avez installés. Tapez exit pour en sortir.

Pour lancer une seule commande dans l'image, sans y entrer :

apptainer exec mon_image.sif ./mon_exe

Sur un serveur avec GPU, ajoutez l'option --nv pour que l'image ait accès à la carte : apptainer shell --nv mon_image.sif.

4. Calcul long : ne pas le perdre en se déconnectant

Un programme lancé normalement s'arrête quand vous fermez le terminal ou que la connexion coupe. Pour un calcul long, lancez-le dans une session tmux : elle continue de tourner sur le serveur même quand vous êtes déconnecté.

Ouvrez une session (ici nommée calcul). Dans le terminal, tapez :

tmux new -s calcul

Le terminal se vide, avec une barre verte en bas : vous êtes dans la session. Lancez votre programme normalement :

./mon_exe

Pour quitter la session sans arrêter le programme, appuyez sur Ctrl+b, relâchez, puis appuyez sur d. Vous pouvez ensuite vous déconnecter du serveur.

Plus tard, reconnectez-vous au même serveur et retrouvez votre session, avec tout ce que votre programme a affiché :

tmux attach -t calcul

Voir la liste de vos sessions : tmux ls
Fermer définitivement une session : dans la session, tapez exit

Calculs de plus de 10 heures : utilisez le cluster SLURM.

L'accès à vos fichiers est protégé par un « ticket » de connexion, valable environ 10 heures à partir de votre connexion : après 10h, votre programme ne peut plus lire ni écrire vos fichiers (erreur Permission denied), même s'il tourne toujours.

Sur le cluster, les tickets des jobs sont renouvelés automatiquement : un job peut tourner plusieurs jours sans problème.

Les règles

Vérifiez la charge du serveur avant de lancer un programme.
N'utilisez jamais 100 % d'un serveur : laissez toujours des cœurs et de la mémoire aux autres.
Calculs longs ou nombreux : utilisez le cluster. Les jobs y sont répartis automatiquement par SLURM.

Plus de détails dans les bonnes pratiques.