Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- python [2019/07/17 14:31] – nicwagne
+++ python [2026/06/24 08:42] (Version actuelle) – admin
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+====== Installer une version de Python en local (Miniforge / conda) ======
+Cette procédure permet à chaque utilisateur d'installer **sa propre version de Python**
+dans son répertoire personnel, sans droits administrateur et indépendamment de la
+version système du cluster. Elle s'appuie sur
+[[https://github.com/conda-forge/miniforge|Miniforge]], une distribution conda légère
+basée sur conda-forge. On peut ainsi créer autant d'environnements isolés que
+nécessaire, chacun avec sa propre version de Python et ses propres paquets.
+===== 1. Téléchargement et installation  =====
+__**A faire depuis un serveur en accès direct : christmas ou l40s02**__
+Installation dans le répertoire personnel (''~'') :
+<code bash>
+# Télécharger l'installeur (Linux x86_64)
+wget https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-Linux-x86_64.sh
+# Installer en mode silencieux dans ~/miniforge3
+bash Miniforge3-Linux-x86_64.sh -b -p ~/miniforge3
+# (optionnel) supprimer l'installeur une fois terminé
+rm Miniforge3-Linux-x86_64.sh
+</code>
+===== 2. Création d'un environnement =====
+<code bash>
+# Charger conda dans le shell courant
+source ~/miniforge3/etc/profile.d/conda.sh
+# Créer un environnement avec Python 3.10
+conda create -n my_env python=3.10 -y
+# Activer l'environnement
+conda activate my_env
+# Vérifier la version
+python --version
+# Installer les paquets voulus
+pip install ...
+</code>
+===== 3. Réutilisation après reconnexion =====
+À chaque nouvelle connexion, il faut recharger conda puis réactiver l'environnement :
+<code bash>
+source ~/miniforge3/etc/profile.d/conda.sh
+conda activate my_env
+</code>
+===== 4. Utilisation dans un script Slurm =====
+Ces deux lignes doivent être placées dans le script **avant** l'appel à Python :
+<code bash>
+source ~/miniforge3/etc/profile.d/conda.sh
+conda activate my_env
+python mon_script.py
+</code>
+===== Remarques =====
+  * **Quota du home** : les environnements conda sont volumineux. Attention à ne pas multiplier les environnements.
+  * **Ne pas lancer ''conda init''** sur le cluster : cela modifie le ''.bashrc'' et peut interférer avec d'autres outils. La méthode par ''source ... conda.sh'' ci-dessus est volontairement préférée.
+/*
 ====== Quelques informations concernant l'utilisation de python sur la plateforme======
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   export HDF5_USE_FILE_LOCKING="FALSE"
-Vous pouvez insérer cette commande dans votre script d'exécution ou encore dans votre bashrc.
+Vous pouvez insérer cette commande dans votre script d'exécution ou encore dans votre bashrc. */