Cette procédure permet à chaque utilisateur d'installer sa propre version de Python dans son répertoire personnel, sans droits administrateur et indépendamment de la version système du cluster. Elle s'appuie sur Miniforge, une distribution conda légère basée sur conda-forge. On peut ainsi créer autant d'environnements isolés que nécessaire, chacun avec sa propre version de Python et ses propres paquets.

A faire depuis un serveur en accès direct : christmas ou l40s02

Installation dans le répertoire personnel (~) :

# Télécharger l'installeur (Linux x86_64)
wget https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-Linux-x86_64.sh
 
# Installer en mode silencieux dans ~/miniforge3
bash Miniforge3-Linux-x86_64.sh -b -p ~/miniforge3
 
# (optionnel) supprimer l'installeur une fois terminé
rm Miniforge3-Linux-x86_64.sh

# Charger conda dans le shell courant
source ~/miniforge3/etc/profile.d/conda.sh
 
# Créer un environnement avec Python 3.10
conda create -n my_env python=3.10 -y
 
# Activer l'environnement
conda activate my_env
 
# Vérifier la version
python --version
 
# Installer les paquets voulus
pip install ...

À chaque nouvelle connexion, il faut recharger conda puis réactiver l'environnement :

source ~/miniforge3/etc/profile.d/conda.sh
conda activate my_env

Ces deux lignes doivent être placées dans le script avant l'appel à Python :

source ~/miniforge3/etc/profile.d/conda.sh
conda activate my_env
 
python mon_script.py

• Quota du home : les environnements conda sont volumineux. Attention à ne pas multiplier les environnements.
• Ne pas lancer conda init sur le cluster : cela modifie le .bashrc et peut interférer avec d'autres outils. La méthode par source … conda.sh ci-dessus est volontairement préférée.